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conciliación de pagos Shopify: el IVA que falta si apunta lo del banco

Una tienda Shopify en España que apunta como venta lo que llega al banco deja fuera del modelo 303 el IVA de las comisiones y los contracargos: en el ejemplo inventado de la hoja, 126,70 € de IVA. Son 18.450,00 € cobrados con Shopify Payments en 312 cobros, 540,00 € de reembolsos, 104,90 € de contracargos y 17.180,00 € ingresados en el banco. La liquidación esperada es 17.339,65 € y faltan 159,65 € sin conciliar.

De dónde salen los 126,70 €

La base imponible del IVA es el importe total de la contraprestación (Ley 37/1992, art. 78.Uno), y el apartado Dos.1.º incluye en ella los gastos de comisiones. Lo que paga su cliente es la venta; la comisión de Shopify Payments es un gasto aparte. Con 17.910,00 € de ventas netas de reembolsos, la base imponible es 14.801,65 € y el IVA repercutido 3.108,35 €. Si apunta como venta los 17.180,00 € del banco, la base sale 14.198,35 € y faltan 126,70 € de IVA. Declararlo después con una complementaria lleva recargo (Ley General Tributaria, art. 27).

Las cuatro restas de una liquidación

1. Comisiones. Con una comisión de ejemplo del 2,10 % más 0,25 € por cobro, son 387,45 € más 78,00 €: 465,45 €, una comisión efectiva del 2,52 %. Su tarifa depende del plan y de la tarjeta: cópiela de Configuración › Pagos.
2. Reembolsos. Según el centro de ayuda de Shopify, con Shopify Payments no se devuelven las tarifas de tarjeta al reembolsar. En 540,00 € reembolsados, la parte en porcentaje de la comisión son 11,34 € que no vuelven.
3. Contracargos. El importe del contracargo se descuenta de la siguiente liquidación disponible, y el banco del titular cobra además una comisión. Escriba los dos juntos, como salen en su informe.
4. Lo que queda: 18.450,00 € − 465,45 € − 540,00 € − 104,90 € = 17.339,65 €.

Qué hacer con la diferencia

Si el banco recibió 17.180,00 €, faltan 159,65 €. Lo habitual es que una liquidación de los últimos días del mes llegue el mes siguiente, o que haya una retención. Abra en Shopify › Finanzas › Liquidaciones la liquidación del primer día del mes siguiente y la de retenciones. Si el banco cuadra (17.339,65 €), la diferencia es 0,00 €, pero apuntar el neto como venta aún deja 98,99 € de IVA fuera del 303.

Un mes con muchos reembolsos

Otro mes inventado: 9.200,00 € cobrados en 160 cobros, 1.350,00 € de reembolsos y 7.616,80 € en el banco. Las comisiones son 233,20 €, la diferencia es 0,00 €, la comisión perdida en reembolsos sube a 28,35 €, la base imponible es 6.487,60 € y el IVA que falta si apunta el neto es 40,48 €.

Qué va a cada cuenta

La venta, por la base imponible. El IVA repercutido, al 303. Las comisiones, 465,45 € en el ejemplo, como gasto en la cuenta 626, servicios bancarios. Así la venta, el IVA y el gasto cuadran con el banco.

Lo que ya existe

En la Shopify App Store, A2X cuesta desde 29 USD al mes y Bookkeep desde 19 USD al mes (consultado el 11/11/2026); sincronizan liquidaciones con QuickBooks en inglés.

Gratis y de pago

La calculadora del navegador es gratis, sin registro y sin límite de usos: 8 datos, 11 cifras, un periodo completo. La hoja .xlsx, de un solo pago, añade la pestaña 12 meses, con una fila por mes, y Trimestres 303, que suma base imponible, IVA repercutido y comisiones de la cuenta 626 por trimestre para su gestoría.